Όργανα Διοίκησης του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ. Ιονίου Πανεπιστημίου είναι: 
α. το Συμβούλιο του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ.
β. ο Πρόεδρος του Συμβουλίου του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ.

Το Συμβούλιο του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ. Ιονίου Πανεπιστημίου συγκροτείται με απόφαση της Συγκλήτου και αποτελείται από:
α. τον Πρόεδρο του Συμβουλίου του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ., 
β. τα μέλη του Συμβουλίου του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ.,
γ. τον Διευθυντή Επιμόρφωσης και Διά Βίου Μάθησης, χωρίς δικαίωμα ψήφου (με θητεία παράλληλη με αυτή του Συμβουλίου).

Πρόεδρος

Εμμανουήλ Μάγκος

Καθηγητής Τμήματος Πληροφορικής, Αντιπρύτανης Έρευνας, Καινοτομίας και Διά Βίου Μάθησης

Μέλη 

Σχολή Ανθρωπιστικών Επιστημών:

• Φώτιος Βασιλείου
  Επίκουρος Καθηγητής, τακτικό μέλος
• Πασχάλης Νικολάου
  Επίκουρος Καθηγητής, αναπληρωματικό μέλος

Σχολή Μουσικής και Οπτικοακουστικών Τεχνών:

• Αγνή Παπαδοπούλου
  Επίκουρη Καθηγήτρια, τακτικό μέλος
• Δήμητρα Χρυσάνθη Ακογιούνογλου,
  Επίκουρη Καθηγήτρια, αναπληρωματικό μέλος

Σχολή Επιστήμης της Πληροφορίας και Πληροφορικής:

• Γεώργιος Παπαιωάννου
  Αναπληρωτής Καθηγητής, τακτικό μέλος
• Αγησίλαος Κονιδάρης
  Αναπληρωτής Καθηγητής, αναπληρωματικό μέλος

Σχολή Οικονομικών Επιστημών:

• Μιλτιάδης Μπότσης
  Επίκουρος Καθηγητής, τακτικό μέλος
• Ιωάννης Πούλιος
  Επίκουρος Καθηγητής, αναπληρωματικό μέλος.

Σχολή Περιβάλλοντος:

• Παναγιώτης Κανδύλης
  Αναπληρωτής Καθηγητής, τακτικό μέλος
• Χρήστος Καρύδης
  Αναπληρωτής Καθηγητής, αναπληρωματικό μέλος

Διευθύντρια Επιμόρφωσης και Διά Βίου Μάθησης

Βιλελμίνη Σωσώνη

Αναπληρώτρια Καθηγήτρια Τμήματος Ξένων Γλωσσών, Μετάφρασης  και Διερμηνείας.