Όργανα Διοίκησης του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ. Ιονίου Πανεπιστημίου είναι: 
α. το Συμβούλιο του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ.
β. ο Πρόεδρος του Συμβουλίου του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ.

Το Συμβούλιο του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ. Ιονίου Πανεπιστημίου συγκροτείται με απόφαση της Συγκλήτου και αποτελείται από:
α. τον Πρόεδρο του Συμβουλίου του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ., 
β. τα μέλη του Συμβουλίου του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ.,
γ. τον Διευθυντή Επιμόρφωσης και Διά Βίου Μάθησης, χωρίς δικαίωμα ψήφου (με θητεία παράλληλη με αυτή του Συμβουλίου).

Πρόεδρος

Ανδρέας Γεωργοτάς

Καθηγητής Τμήματος Μουσικών Σπουδών,  Αντιπρύτανης Προγραμματισμού, Ανάπτυξης, Νησιωτικότητας και Διά Βίου Μάθησης

Μέλη 

Σχολή Ανθρωπιστικών Επιστημών:

• Φώτιος Βασιλείου
  Επίκουρος Καθηγητής, τακτικό μέλος
• Πασχάλης Νικολάου
  Αναπληρωτής Καθηγητής, αναπληρωματικό μέλος

Σχολή Μουσικής και Οπτικοακουστικών Τεχνών:

• Αγνή Παπαδοπούλου
  Αναπληρώτρια Καθηγήτρια, τακτικό μέλος
• Κυριακή Βουγιούκα,
  Επίκουρη Καθηγήτρια, αναπληρωματικό μέλος

Σχολή Επιστήμης της Πληροφορίας και Πληροφορικής:

• Γεώργιος Παπαιωάννου
  Καθηγητής, τακτικό μέλος
• Αγησίλαος Κονιδάρης
  Αναπληρωτής Καθηγητής, αναπληρωματικό μέλος

Σχολή Οικονομικών Επιστημών:

• Μιλτιάδης Μπότσης
  Αναπληρωτής Καθηγητής, τακτικό μέλος
• Παναγιώτης Μανωλιτζάς
  Αναπληρωτής Καθηγητής, αναπληρωματικό μέλος.

Σχολή Περιβάλλοντος:

• Παναγιώτης Κανδύλης
  Αναπληρωτής Καθηγητής, τακτικό μέλος
• Χρήστος Καρύδης
  Αναπληρωτής Καθηγητής, αναπληρωματικό μέλος

Διευθυντής Επιμόρφωσης και Διά Βίου Μάθησης
Αριστείδης Βραχάτης
Επίκουρος Καθηγητής Τμήματος Πληροφορικής